L’UMR-EIO s’est structurée en trois thèmes, tous focalisés sur des enjeux majeurs pour le développement intégré et durable de la Polynésie française. Au-delà, chacun de ces 3 thèmes relève de problématiques scientifiques centrales pour comprendre le fonctionnement et la réponse des écosystèmes insulaires et ils s’inscrivent directement au cœur de plusieurs ODD (principalement les ODD 13, 14 et 15, mais aussi de manière secondaire les ODD n°2 et 11). Les objectifs et le champ d’investigation de chaque thème sont décrits dans les onglets relatifs à chacun d’eux.
Structuration de l’UMR-EIO en trois thèmes. Chacun des trois thèmes est scindé en deux ou trois axes complémentaires :